生物信息学中，基因组学、蛋白组学、代谢组学差别有多大？

@pythonic生物人 简单分享一下基因组学、蛋白组学、代谢组学差别！

• 基因组学，genomics：可能要发生什么
• 转录组学，transcriptomics && 蛋白组学，proteomics：即将要发生什么
• 代谢组学，metabolomics：已经发生了什么或正在发生什么

所以，如下图，基因组学、蛋白组学、代谢组学处于中心法则的上中下不同位置，研究的对象完全不一样，

以下简单介绍下。

基因组学

研究对象：DNA；

临床主要目的：找变异，如SNV/indel/fusion/CNV/SV，进一步分析HLA type、TMB、MSI、TNB等等生物标志物，最终关联到临床，指导患者早筛、预后等等；

常用技术：WGS（Low-pass NIPT/NIPTPLUS/CNVseq、标准WGS）、WES、panel等技术。

也可简单看看都在分析个啥？

• Omics精进06|Gene panel检测报告解读
• Omics精进02|临床Gene Panel设计
• Omics精进01|临床WGS/WES/Gene Panel/Single gene异同

蛋白组学

研究对象

• 蛋白质

研究内容+常用技术

Bottom-up，Top-down两种研究路线

• Top-down蛋白组研究路线：

• bottom-up蛋白组研究路线：

代谢组学

研究对象：区别于DNA、蛋白质这类大分子，一般为生物体内<1200 Da小分子代谢物集合，如糖、氨基酸、维生素、激素等。

检测方法：按照原理可分为3大类：

• 非靶向（Untargeted Metabolomics）
• 靶向（Targeted Metabolomics）
• 广泛靶向（Widely-targeted metabolomics）

使用技术：NMR、LC-MS、GC-MS

分析流程：

简单介绍一下Mass spectrometry-based 代谢组学的分析流程。

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